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平台簡介  
 
北京生科院技術平台簡介

  为探索北京生科院大型仪器管理模式和构建研究院开放研究中心设施基础,北京生科院成立“中科院北京生命科学研究院技術平台”(以下简称技術平台),负责管理研究院的公用大型科研设施和儀器設備,为相关学科的科学研究与人才培养工作提供技术支撑与测试服务,同时作为中科院北京生命科学大型仪器区域中心的组成单元,面向科研院所对社会开放。  

  技術平台管理委员会负责制订平台建设规划和运行管理的规章制度,评议建设及运行管理方案,指导和监督平台的运行与共享。技術平台管理委员会设有平台管理办公室,负责平台的日常运行和行政管理。技術平台设首席技术专家,为公共技术支撑某一技术领域的技术带头人,并根据运行管理的要求,设置若干专业技术组,由专业技术组组长全面负责组内各项设施设备的运行和管理。 

  目前技術平台设有生物计算组和高通量測序组两个专业技术组,拥有达到12.6万亿次/秒计算能力的超算服务器集群以及高通量測序仪Hiseq 2000和自动聚焦声波样本处理仪Covaris S220、基因组DNA剪切仪Hydroshear Plus、生物分析仪Agilent 2100、实时荧光定量PCR仪Agilent Strategene Mx3000P、真空泵等配套设备。 

  生物計算組超算服務器集群擁有72個計算節點(包含2個胖節點),計算能力達到12.6萬億次/秒;搭建了120TB的先進高性能集群NAS計算存儲和192TB高速測序存儲;配備多個序列數據庫和Perl、R、matlab、JAVA等開發語言環境,形成了以高性能計算、高通量基因組學數據分析、序列拼接、表觀遺傳學、基因芯片分析、小RNA分析、轉錄組分析爲核心的分析路線和體系,並自主研發了inGAP等計算生物學數據處理軟件。 

  高通量測序组已能够提供包括普通转录组、单一物种基因组、Meta基因组和目标区域基因组在内的常规测序服务。同时通过小样本摸索,掌握和优化了CHIP、甲基化、外显子组及去rRNA转录组的文库构建实验方法,能够为相关科研提供关键解决技术。 

  技術平台旨在为科研人员提供高效、优质的技术支撑与开放服务,欢迎大家莅临指导。 

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